Ct

Odporúčaný termín [?]

Oblasť:	lekárska veda, imunológia, lekárska diagnóza
Definícia:	semikvantitatívna hodnota, ktorá všeobecne kategorizuje koncentráciu vírusového genetického materiálu vo vzorke pacienta testovanej pomocou RT-PCR testu na nízku, strednú alebo vysokú - tzn. že približne udáva, aké množstvo vírusového genetického materiálu sa vo vzorke nachádza
Zdroj:	PODĽA: Understanding cycle threshold (Ct) in SARS-CoV-2 RT-PCR. A guide for health protection teams. Public Health England. PHE gateway number: GW-1651. 2020. 12 pp. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/926410/Understanding_Cycle_Threshold__Ct__in_SARS-CoV-2_RT-PCR_.pdf

---

Kontext:	V reakcii RT-PCR sa zaznamenáva počet opakovaných cyklov potrebných na namnoženie nukleovej kyseliny. Cyklus, v ktorom termocyklér zaznamená tvorbu PCR produktu v reakcii, sa označuje Ct (cycle threshold). Typická RT-PCR analýza má 40 termálnych cyklov. Ct hodnota je semikvantitatívna, umožňuje rozlišovať medzi vysokou a nízkou vírusovou náložou. Čím nižšia je Ct hodnota, tým vyššia je vírusová nálož v analyzovanej vzorke. Ct hodnoty získané z RT-PCR analýz vykonaných rôznymi diagnostickými súpravami nie je možné porovnávať v dôsledku odlišností medzi súpravami, ako sú reagencie, cieľové gény, parametre cyklov, metódy prípravy vzoriek, metódy extrakcie RNA, rôzne detekčné limity atď. Nízke Ct hodnoty (vysoká vírusová nálož) sú pravdepodobným indikátorom akútnej infekcie a vysokej infekčnosti pacienta. Klinický význam výsledkov pozitívnych v teste RT-PCR SARS-CoV-2 s vysokou hodnotou Ct (nízkou vírusovou náložou) je možné interpretovať iba v kontexte s klinickým stavom a anamnézou pacienta. Interpretáciu nie je možné vykonávať na základe jednej hodnoty Ct, je vhodnejšie mať sériu Ct hodnôt pacienta stanovených v konkrétnom laboratóriu s rovnakým postupom izolácie a detekcie RNA SARS-CoV-2.
Zdroj kontextu:	Czirfuszová, M. a kol.: Štandardný postup pre mikrobiologickú diagnostiku pri suspektnej infekcii vírusom SARS-CoV-2 pre laboratóriá klinickej mikrobiológie (v2.0/19. 2. 2021).
Príbuzné termíny:	vírusová nálož, vírusová záťaž, COVID-19, RT-PCR test, polymerázová reťazová reakcia
Cudzojazyčný ekvivalent:	en: cycle threshold
URL:	https://standardnepostupy.sk/ files/200000790-3186b3186d/%C5%A0DTP mikrobiologicka diagnostika COVID 19 19022021.pdf